Adaptación para múltiples GPU de un simulador de actividad eléctrica en el corazón

Víctor M. García, Antonio M. Vidal, Alejandro Liberos, Andreu M. Climent

Resumen


La simulación de la actividad eléctrica del corazón se calcula mediante la resolución de un gran sistema de ecuaciones diferenciales ordinarias, que necesita una enorme cantidad de tiempo de computación. Sin embargo, en los últimos años se están introduciendo, en el ámbito de la computación de alto rendimiento, las unidades de procesamiento gráfico (GPU). Estos potentes dispositivos han atraído a grupos de investigación que requieren simular la actividad eléctrica del corazón. El grupo de investigación que firma este artículo ha desarrollado un simulador de actividad eléctrica cardíaca que se ejecuta en una sola GPU. En este artículo se describe la adaptación y modificaciones de dicho simulador para su ejecución en múltiples GPU. Los resultados confirman que la técnica empleada permite reducir sensiblemente los tiempos de ejecución respecto a los que se obtienen con una sola GPU, además de permitir afrontar problemas mucho más grandes.

Palabras clave


Ecuaciones diferenciales ordinarias, programación GPU, simulación electrocardíaca

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